O CGEE é uma Organização Social, qualificada pelo Decreto n° 4.078, de 9 de janeiro de 2002, cuja missão é subsidiar processos de tomada de decisão em temas relacionados à ciência, tecnologia e inovação, por meio de estudos de prospecção e avaliação estratégica, desenvolvidos com ampla articulação com especialistas e instituições do Sistema Nacional de Ciência, Tecnologia e Inovação (SNCTI).